L'analisi dei polimorfismi del cromosoma X (spesso marcatori STR - Short Tandem Repeats) è una tecnica genetica avanzata utilizzata principalmente per test di parentela complessi (es. tra sorelle o tra nonni e nipoti) e in genetica forense. Poiché le donne ereditano un cromosoma X dalla madre e uno dal padre, l'analisi del loro aplotipo X permette di risalire alla linea paterna con alta precisione.